两研究小组公布“人类蛋白质组地图”
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有两个独立的研究小组最近各自公布了接近完成的“人类蛋白质组草图”,其中之一是由印度和美国的研究人员组成的联合研究,另一项研究则是由德国的科学家完成。
两个研究小组都使用先进的设备对人体组织上的蛋白质进行了收集,并制作了一份详尽的人类蛋白质组地图--也就是人类基因组的蛋白质当量。第一项研究由印度生物信息研究所和美国约翰霍普金斯大学等机构的科学家共同完成,他们描绘了由17924个(大约相当于已注释基因总数的84%)基因编码的蛋白质所组成的地图。另一个德国的研究小组则是将人体内现有的19629种蛋白质中的92%进行了编目分类。
除此之外,两个研究小组都发现了一些由先前被认为是“无用”基因或是不具备功能的DNA编码的蛋白质,研究发现虽然科学家们已经对人类的基因信息进行了长期的整理归纳,但依然还有几个基因的功能是不能确定的。印度的研究小组找到了至少200个以前未被发现的人类蛋白质,并将他们称为“失落的蛋白质”。
这次组建的新数据库与在2003年完成的人类基因组计划类似,这份“蛋白质地图”目前虽然还不完整,但足以填补在蛋白质研究领域中的空白,研究人员对这个蛋白质数据库的诞生感到十分的激动。
据来自班加罗尔生物信息学研究所的Harsha Gowda博士介绍,这次两个研究小组在互相不知道对方工作内容的情况下不约而同的绘制出了这份草图,实在是一个让人惊奇的巧合。他认为今后将两个数据库进行对比完善会是一件有趣的事,也能够帮助我们扩展对人类蛋白质组的了解。
另一方面,德国方面研究的首席作者,慕尼黑理工大学的Bernhard Kuster教授表示,Pandey 的研究论文是一个很了不起的成果,双方的研究都大幅度的提升了我们对人类蛋白质组合基因组的了解。这个Pandey指的正是约翰霍普金斯大学的Akhilesh Pandey,他与印度班加罗尔的研究人员一起致力于蛋白质组地图的研究。
两个研究小组使用了略有不同的方式来绘制人类蛋白质组地图,印度的研究人员表示他们通过从30个人体组织样本身上移除蛋白质的方式“白手起家”,然后使用质谱分析法找到了这些蛋白质的元素丰度,研究小组在这个过程中只使用了普通蛋白质,所有的研究数据都从一个单独的平台获得。
据Akhilesh Pandey介绍,他们的实验室获得的数据将成为业界的“黄金标准”,因为这些数据是通过统一的方法和分析产生的。
而德国的研究小组则从公共数据库收集数据,并将这些数据与实验室生成的数据进行合并。
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